RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SOX17-201ENST00000297316 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
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SOX17-201ENST00000297316 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SOX17-201ENST00000297316 SEC24BO95487 1268 aa26.81■■□□□ 1.88
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SOX17-201ENST00000297316 GCC1Q96CN9 775 aa26.73■■□□□ 1.87
SOX17-201ENST00000297316 USP16Q9Y5T5 823 aa26.73■■□□□ 1.87
SOX17-201ENST00000297316 PDIA6Q15084 440 aa26.72■■□□□ 1.87
SOX17-201ENST00000297316 DISP2A7MBM2 1401 aa26.72■■□□□ 1.87
SOX17-201ENST00000297316 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.72■■□□□ 1.87
SOX17-201ENST00000297316 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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