RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 ATG3Q9NT62 314 aa24.36■■□□□ 1.49
PTX4-201ENST00000293922 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.35■■□□□ 1.49
PTX4-201ENST00000293922 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PTX4-201ENST00000293922 UTRNP46939 3433 aa24.33■■□□□ 1.49
PTX4-201ENST00000293922 C4BP0C0L5 1744 aa24.33■■□□□ 1.49
PTX4-201ENST00000293922 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PTX4-201ENST00000293922 CABP4P57796 275 aa24.32■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.32■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 CFAP53Q96M91 514 aa24.32■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 ITPK1Q13572 414 aa24.31■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.31■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.3■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 ATP6V1AP38606 617 aa24.29■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.29■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 ARXQ96QS3 562 aa24.29■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.29■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.28■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 AK7Q96M32 723 aa24.28■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 MSH5O43196 834 aa24.27■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.27■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 SYT17Q9BSW7 474 aa24.27■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 LGR6Q9HBX8 967 aa24.27■■□□□ 1.48
PTX4-201ENST00000293922 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.26■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 POLD1P28340 1107 aa24.25■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 SMIM5Q71RC9 77 aa24.25■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.24■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.24■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 MAP3K5Q99683 1374 aa24.23■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 MRC1P22897 1456 aa24.23■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.23■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 PHF14O94880 888 aa24.22■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 SSFA2P28290 1259 aa24.22■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 MSL1Q68DK7 614 aa24.22■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.22■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 GNPATO15228 680 aa24.21■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.21■■□□□ 1.47
PTX4-201ENST00000293922 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 NUDCQ9Y266 331 aa24.19■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 PRKAR2BP31323 418 aa24.18■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.18■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.18■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.18■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.17■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.15■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.15■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
PTX4-201ENST00000293922 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.14■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 SLC39A6Q13433 755 aa24.14■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 IL17REQ8NFR9 667 aa24.14■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 KLHL34Q8N239 644 aa24.13■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 TJP1Q07157 1748 aa24.13■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 FCHSD2O94868 740 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 RPS6KA4O75676 772 aa24.11■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.11■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 ADRA2BP18089 450 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX4-201ENST00000293922 TEFQ10587 303 aa24.08■■□□□ 1.44
PTX4-201ENST00000293922 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PTX4-201ENST00000293922 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.06■■□□□ 1.44
PTX4-201ENST00000293922 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.05■■□□□ 1.44
PTX4-201ENST00000293922 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PTX4-201ENST00000293922 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PTX4-201ENST00000293922 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.04■■□□□ 1.44
PTX4-201ENST00000293922 GYS1P13807 737 aa24.03■■□□□ 1.44
PTX4-201ENST00000293922 RFC4P35249 363 aa24.03■■□□□ 1.44
PTX4-201ENST00000293922 ZNF790Q6PG37 636 aa24.03■■□□□ 1.44
PTX4-201ENST00000293922 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.03■■□□□ 1.44
PTX4-201ENST00000293922 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PTX4-201ENST00000293922 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.03■■□□□ 1.44
PTX4-201ENST00000293922 C4AP0C0L4 1744 aa24.03■■□□□ 1.44
PTX4-201ENST00000293922 MMP10P09238 476 aa24.01■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 YY1P25490 414 aa24.01■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.01■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.01■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 GPR162Q16538 588 aa24.01■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 MCM10Q7L590 875 aa24.01■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 RUNDC1Q96C34 613 aa24.01■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 CCDC146Q8IYE0 955 aa24■■□□□ 1.43
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