RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264719.5

EFR3B-201, Transcript of EFR3 homolog B, humanhuman

TSL 5

Gene EFR3B, Length 1,980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3B-201ENST00000264719 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.47■□□□□ 0.87
EFR3B-201ENST00000264719 SLC4A2P04920 1241 aa20.46■□□□□ 0.87
EFR3B-201ENST00000264719 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.45■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.45■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 G2E3Q7L622 706 aa20.45■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.45■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 SLC39A6Q13433 755 aa20.44■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.44■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 DCAF5Q96JK2 942 aa20.44■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.44■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 MS4A1P11836 297 aa20.43■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 SKAP1Q86WV1 359 aa20.43■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.43■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.43■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.43■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.43■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.42■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 RGS12O14924 1447 aa20.42■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 ABCC4O15439 1325 aa20.41■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 IGHDP01880 384 aa20.41■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.41■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.41■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.41■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.39■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.39■□□□□ 0.86
EFR3B-201ENST00000264719 STK31Q9BXU1 1019 aa20.39■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.38■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 ZNF790Q6PG37 636 aa20.38■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 MRC1P22897 1456 aa20.38■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 DISP2A7MBM2 1401 aa20.38■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 CABP4P57796 275 aa20.37■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 JCADQ9P266 1359 aa20.37■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 F6X3S4 739 aa20.37■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.37■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 ANXA1P04083 346 aa20.36■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.36■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 PTPRCP08575 1304 aa20.36■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.35■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 NRAPQ86VF7 1730 aa20.35■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 FLIIQ13045 1269 aa20.35■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 C8orf37Q96NL8 207 aa20.35■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 SLIT2O94813 1529 aa20.34■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 HSPA1LP34931 641 aa20.34■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.34■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 HOXB7P09629 217 aa20.34■□□□□ 0.85
EFR3B-201ENST00000264719 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.33■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 AAMPQ13685 434 aa20.32■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 LRP6O75581 1613 aa20.32■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 PROSER3Q2NL68 480 aa20.32■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.32■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.32■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.3■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.3■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 NGLY1Q96IV0 654 aa20.3■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.29■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.29■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.29■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.28■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 EXOC5O00471 708 aa20.28■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.28■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 C5P01031 1676 aa20.28■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 USP16Q9Y5T5 823 aa20.27■□□□□ 0.84
EFR3B-201ENST00000264719 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.26■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 MEIS3Q99687 375 aa20.26■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 GLI3P10071 1580 aa20.26■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.26■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 PDIA6Q15084 440 aa20.25■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.25■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 TNS2Q63HR2 1409 aa20.25■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.25■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.25■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 PIGBQ92521 554 aa20.24■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 MYT1Q01538 1121 aa20.23■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 DDB1Q16531 1140 aa20.23■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 MYL6BP14649 208 aa20.23■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
EFR3B-201ENST00000264719 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms