RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 IFT57Q9NWB7 429 aa24.16■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.15■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.15■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 SLC39A6Q13433 755 aa24.15■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 IL16Q14005 1332 aa24.14■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 CHL1O00533 1208 aa24.14■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 GNAI1P63096 354 aa24.14■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.14■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.13■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 TSPYL6Q8N831 410 aa24.13■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.13■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 CABP4P57796 275 aa24.12■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.12■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 BTBD11A6QL63 1104 aa24.12■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.11■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.11■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.11■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.1■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 KCNQ2O43526 872 aa24.09■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 RXRBP28702 533 aa24.09■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.08■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 ITGB4P16144 1822 aa24.08■■□□□ 1.45
PRRT1-201ENST00000211413 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.07■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 PIGBQ92521 554 aa24.07■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.05■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.05■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.04■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.04■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.04■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.03■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 NECTIN2Q92692 538 aa24.03■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 MRC1P22897 1456 aa24.03■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF790Q6PG37 636 aa24.02■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.02■■□□□ 1.44
PRRT1-201ENST00000211413 BCAR3O75815 825 aa24.01■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.01■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 RGS12O14924 1447 aa24.01■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 VAMP4O75379 141 aa24■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 ANP32EQ9BTT0 268 aa24■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 ATG3Q9NT62 314 aa23.98■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 BCL9O00512 1426 aa23.98■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 PLIN1O60240 522 aa23.97■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.96■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.96■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.96■■□□□ 1.43
PRRT1-201ENST00000211413 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.94■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 SBF2Q86WG5 1849 aa23.94■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 KCNQ4P56696 695 aa23.92■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.92■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 USP16Q9Y5T5 823 aa23.92■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 C5P01031 1676 aa23.91■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 PAPPAQ13219 1627 aa23.91■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM37O94972 964 aa23.91■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.91■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 ANXA1P04083 346 aa23.9■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 TNNQ9UQP3 1299 aa23.9■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.9■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.9■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.89■■□□□ 1.42
PRRT1-201ENST00000211413 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.88■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 BTAF1O14981 1849 aa23.88■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.87■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.87■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 NHSQ6T4R5 1651 aa23.86■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 PROSER3Q2NL68 480 aa23.85■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 G2E3Q7L622 706 aa23.85■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.85■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.84■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 SLC4A2P04920 1241 aa23.84■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.84■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 PALLDQ8WX93 1383 aa23.84■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
PRRT1-201ENST00000211413 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.82■■□□□ 1.4
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