RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001700.6

Hoxc13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc13, Length 2,461 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Frat1P70339 274 aa26.72■■□□□ 1.87
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa26.71■■□□□ 1.87
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Adamts12Q811B3 1600 aa26.7■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mcm2P97310 904 aa26.7■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Atg3Q9CPX6 314 aa26.7■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Uggt2E9Q4X2 1504 aa26.7■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Klra4Q60651 263 aa26.69■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa26.69■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Q9D2X8 372 aa26.69■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa26.69■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Nsd3Q6P2L6 1439 aa26.69■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Spag5Q7TME2 1165 aa26.68■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa26.68■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Exoc6bA6H5Z3 810 aa26.68■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 EvcP57680 1005 aa26.68■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Wdr24Q8CFJ9 790 aa26.68■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rnf123Q5XPI3 1314 aa26.68■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Znf532Q6NXK2 1036 aa26.67■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pnpla2Q8BJ56 486 aa26.66■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tmx4Q8C0L0 335 aa26.66■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa26.66■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa26.66■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mmp14P53690 582 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Abca16E9PWJ7 1678 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Os9Q8K2C7 672 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Spata31d1bE9QA57 1361 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pik3r4Q8VD65 1358 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Abca9Q8K449 1623 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Surf1P09925 306 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 PdcQ9QW08 244 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 EappQ5BU09 281 aa26.64■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa26.64■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ttc37F8VPK0 1563 aa26.64■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 DpydQ8CHR6 1025 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Hmx1O70218 332 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ttc27Q8CD92 847 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zkscan3Q91VW9 553 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Hmgn5Q9JL35 406 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Fmnl2A2APV2 1086 aa26.62■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 RargP18911 458 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Spata16Q8C636 571 aa26.62■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kif3cO35066 796 aa26.62■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Fsd2Q8BZ52 692 aa26.62■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cgref1Q8R1U2 281 aa26.62■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gm20521D3Z5F7 333 aa26.61■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ubn2Q80WC1 1314 aa26.61■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ercc3P49135 783 aa26.61■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 NinlQ6ZQ12 1394 aa26.61■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tyro3P55144 880 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Adgrl1Q80TR1 1466 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 AknaQ80VW7 1404 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Adck5Q80V03 582 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Elf2Q9JHC9 593 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Hfm1D3Z4R1 1434 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ubap1lG3UW59 384 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Btn2a2A4QPC6 514 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Atp2b1G5E829 1220 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ccdc38Q8CDN8 563 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cd22P35329 862 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 CalcaP70160 136 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zranb2Q9R020 330 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Caskin1Q6P9K8 1431 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cfap58B2RW38 873 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Polr3gQ6NXY9 223 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Lrrc8aQ80WG5 810 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Wdr3Q8BHB4 942 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cwc15Q9JHS9 229 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ranbp1P34022 203 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pwp2Q8BU03 919 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Usp40Q8BWR4 1235 aa26.57■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 KinQ8K339 391 aa26.57■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Abcc2Q8VI47 1543 aa26.56■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Hecw2Q6I6G8 1578 aa26.56■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cavin4A2AMM0 362 aa26.56■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Babam1Q3UI43 333 aa26.56■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ap3b2Q9JME5 1082 aa26.56■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Stx6Q9JKK1 255 aa26.55■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Atp10dQ8K2X1 1416 aa26.54■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 L1td1Q587J6 782 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Trak2Q6P9N8 913 aa26.54■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa26.54■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Strn4P58404 760 aa26.54■■□□□ 1.84
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.4 ms