Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms