Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA3Q9UL41 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA3Q9UL41 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms