Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED9Q9NWA0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED9Q9NWA0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms