Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BSDC1Q9NW68 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms