Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms