Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA1549Q9HCM3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms