Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC52A2Q9HAB3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms