Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms