Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms