Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms