Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms