Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC4Q6P2E9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms