Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF18Q5VWM3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms