Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms