Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM78BQ5VT40 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM78BQ5VT40 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM78BQ5VT40 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM78BQ5VT40 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM78BQ5VT40 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM78BQ5VT40 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM78BQ5VT40 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM78BQ5VT40 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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