Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHSL1Q5SYE7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms