Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C10orf55Q5SWW7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C10orf55Q5SWW7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C10orf55Q5SWW7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C10orf55Q5SWW7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C10orf55Q5SWW7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C10orf55Q5SWW7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C10orf55Q5SWW7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C10orf55Q5SWW7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C10orf55Q5SWW7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms