Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms