Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms