Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRIK5Q16478 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms