Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALX1Q15699 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
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