Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRADDQ15628 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms