Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRKQ15262 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
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