Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
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