Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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