Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms