Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms