Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms