Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms