Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPCQ01831 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPCQ01831 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPCQ01831 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPCQ01831 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPCQ01831 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPCQ01831 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPCQ01831 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
XPCQ01831 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPCQ01831 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPCQ01831 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPCQ01831 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
XPCQ01831 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPCQ01831 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPCQ01831 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPCQ01831 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPCQ01831 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPCQ01831 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPCQ01831 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPCQ01831 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPCQ01831 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPCQ01831 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPCQ01831 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPCQ01831 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPCQ01831 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms