Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms