Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP1P63208 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP1P63208 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms