Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-24P63145 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms