Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO4P61968 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms