Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB25P57735 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms