Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CASP7P55210 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP7P55210 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP7P55210 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP7P55210 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms