Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA2D1P54289 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms