Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLCP48506 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLCP48506 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLCP48506 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLCP48506 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLCP48506 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLCP48506 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLCP48506 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GCLCP48506 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GCLCP48506 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLCP48506 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLCP48506 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms