Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF4P34130 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF4P34130 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms