Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms