Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms