Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD1P28340 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD1P28340 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLD1P28340 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLD1P28340 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLD1P28340 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLD1P28340 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLD1P28340 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLD1P28340 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLD1P28340 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLD1P28340 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD1P28340 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD1P28340 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD1P28340 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD1P28340 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD1P28340 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD1P28340 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD1P28340 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD1P28340 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD1P28340 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLD1P28340 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms