Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXP28300 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXP28300 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms