Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms