Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTX3P26022 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTX3P26022 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTX3P26022 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTX3P26022 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTX3P26022 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTX3P26022 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms